Arthur, der i sin sommerferie bliver passet af sin bedstemor ude på landet. Bedstefaren forsvandt på mystisk vis for fire år siden og efterlod en notesbog, hvor han fortæller om den afrikanske stamme Minimoyserne, som kun er 2 mm høje. Men findes de i virkeligheden? Og hvordan får man dem at se? Og hvor er den funklende skat med rubiner, som bedstefaren fik af stammen Bogo-Matassalajerne? Samtidig med disse spørgsmål dukker den lede Hr. Davido op, som i mange år har hævdet at være den rette ejer af bedstemorens charmerende gamle hus. Hvis ikke hun betaler sin gæld inden 72 timer, må hun overlade alt til Hr. Davido.

Alt dette sender Arthur ud på et eventyr, han aldrig i sin vildeste fantasi havde forestillet sig, da han opdager vejen til Minimoysernes land og på bare 3 dage skal finde bedstefarens skat, kæmpe mod de ondskabsfulde krigere seïderne samt deres onde mester, Maltazar den modbydelige, og nå at vende tilbage med skatten for at redde sin bedstemors hus - og Minimoyserne.

I Arthur og Minimoyserne hører vi om Arthurs opdagelse af Minimoysernes land og mødet med de to Minimoysere - den ærekære prinsesse Selenia og hendes lillebror prins Betameche. Sammen drager de ud på en utrolig rejse i en verden, hvor alting er meget mere farefuldt, når man kun er 2 mm høj.