I Universet i et enkelt atom undersøger og diskuterer Dalai Lama de store paradigmer og viser sammenhængen mellem tilsyneladende uforenelige begreber som evolution og karma.

Ofte har tro og videnskab ført til strid og uenighed, men Dalai Lama ser det frugtbare i at kombinere dem og viser, at de både komplementerer hinanden og har samme mål: søgen efter sandhed.

Dalai Lama har hele livet igennem beskæftiget sig med videnskabelige studier og religiøs praksis. I denne bog viser han fordelene ved at kombinere videnskab og buddhisme og derigennem finde fred, både inde og uden for sig selv.