ved, hvordan vi hidtil har fortolket kunst.

Javier Sierra har sat sig for at efterforske verdens mysterier, og i Den hemmelige nadver er det ét af Leonardo da Vincis mesterværker, der kommer under hans kærlige behandling. Som millioner af andre mennesker rundt om i verden, er han overbevist om, at mange af de ´officielle versioner´ af historien, som vi præsenteres for, er diskutable. Derfor fokuserer han på det, han kalder de ´sorte huller´ i historien, som er fængslende facts der opfattes som kontroversielle af eksperterne, men som er virkelige og ofte fulde af forunderlige detaljer, han kan bygge sin historie på.

´Den sidste nadver´ har, til trods for Leonardo da Vincis valg af materialer, overlevet tidens gang og uroligheder, og med den sidste restaurering af vægmaleriet i slutningen af 1990´erne, er det nu muligt at afkræfte nogle af de teser det 20. århundrede har budt på samtidig med at nye er opstået.
I Den hemmelige nadver befinder vi os på tidpunktet, hvor Leonardo da Vinci er ved at lægge sidste hånd på sin fortolkning af ´Den sidste nadver´ i klosteret Santa Maria delle Grazie i Milano. Paven har gennem en række anonyme og yderst velinformerede breve, fået for øre, at maleriet indeholder bizarre og blasfemiske budskaber.
Den dominikanske inkvisitor og kodeekspert Augustin Leyre sendes derfor til byen for at efterforske sagen, og snart er han viklet ind i en række ideologiske konspirationer, der fører til mord og overraskende afsløringer.