Gregorius bygger på Hjalmar Söderbergs hundrede år gamle klassiker ´Doktor Glas´. I klassikeren fremstilles pastor Gregorius som et helt igennem afskyeligt menneske - han er liderlig, hyklerisk og indskrænket, og da doktor Glas til sidst tager livet af ham, gør han nærmest menneskeheden en tjeneste.
Gregorius lader Bengt Ohlsson pastoren selv fortælle om det, der skal blive hans sidste sommer, og hans person får et helt andet liv. Vi følger hans opvækst som en eksemplarisk søn og hans dybe og skamfulde forelskelse i Helga - den unge pige, der en gang skal blive hans anden hustru. Da hustruens utroskab bliver åbenlys for ham, kastes han ud i en malstrøm af følelser: fortvivlelse, selvforagt og en paradoksal håbefuldhed. Under sit ophold på kurstedet i Porla møder han atter Helga og får en slags oprejsning, og muligheden for at leve et helt nyt liv viser sig.

I Bengt Ohlssons personificering er pastor Gregorius en bange og dybt usikker mand. En mand som i sit daglige virke møder mennesker, som tørster efter kærlighed samtidig med at de viger tilbage fra den. Til sidst tvinges Gregorius til at indse, at han selv er sådan et menneske.