Havets helte – Flådens gåde er andet bind i en ny letlæsningsserie om Ella, Ali, Hugo og deres nye ven Malik, som kommer ud på endnu et spændende eventyr. Denne gang er de på sejltur op ad floden, men turen tager hurtigt en uventet drejning, da de finder mystiske spor i en hule og en cykel på bunden...