Det frie demokratiske samfund har spillet fallit, og en mand har opsøgt en arbejdskommune for at komme i kontakt med sig selv. Manden kommer først til at arbejde som pæremand og forfremmes senere til afhugger, hvilket indebærer en homofil, voldsbaseret livsstil. Afhuggerne dyrker den visionære formand Larsen, der foranstalter et blodigt oprør. Oprøret bliver slået ned, og manden bliver spærret inde. Her møder manden Eva. Et møde, der både skal lede til forelskelse og forfald.

Idioteque ligger i naturlig forlængelse af Thomsens tre forrige udgivelser Baljen (2002), Malonecity 1+2 (2006), og han fortsætter i den sin egen afsøgning af, hvad genren kan.