Det går op for Jiraiya, at Pain – der i Amegakure opfattes som en gud – i virkeligheden er seks forskellige krigere med rinnegan. En af dem viser sig at være Jirayas gamle elev Yahiko. Men er det virkelig Pains eneste hemmelighed? I mellemtiden finder Sasuke endelig frem til Itachi – og det uundgåelige...