Karriereembedsmanden David Wolff får chancen for at lede en hjælpeorganisation i et Afghanistan oven på de internationale kampstyrkers exit efter 2014. Det går hurtigt op for ham, at især Iran og USA kører deres helt egne spil, som gør neutralt hjælpearbejde umuligt. Wolff bliver i stedet brugt som en nyttig idiot til andre og tvivlsomme formål.

Udstationeringen udvikler sig til et mareridt. Wolff bliver stik mod sin vilje en vigtig brik i spillet mellem en iransk konsul og en amerikansk CIA-agent.

En ny og livsfarlig viden om, hvad der foregår, får blodige konsekvenser på en flugt gennem et land i opløsning.

Missilhotellet er en spændingsroman, men også en besk kommentar til, hvordan udenlandske interesser sammen med inkompetente, anløbne, afghanske ledere er med til at ødelægge et land med krigstrætte mennesker, som troede, at deres land skulle bygges op på ny.