Brodie, Hunter og Tusia er tilbage på Station X på Bletchley Park og kæmper fortsat med det store ubesvarede spørgsmål: Hvad er hemmeligheden bag det gamle, kodede Voynich-manuskript? Deres første eventyr forlod dem med en musikalsk boks, der spiller en melodi af komponisten, Elgar, der elskede koder. De tre venner kommer med ét af sted på en ny mission, der fører dem frem til historierne bag Elgars berømte musik og et kodet brev, han skrev til sin unge ven, Dorabella – et brev, hvis kode aldrig er blevet løst.  

Af forviklede spor ender de tre venner som vidner til bogafbrændninger i Firenze, møder en mystisk forældreløs dreng og kommer på sporet af en hemmelig organisation, der modarbejder deres jagt på kodens løsning – og er parat til at dræbe for at forhindre sandheden i at komme frem …