Major Kusanagi er med nød og næppe undsluppet en fælde, som Dukkeføreren har sat. Hun slipper fri, men er tvunget til at efterlade sin krop. Med hendes afmonterede hjerne ved siden af sig begynder Batou at lede efter en ny krop i en kamp mod uret. Der er ikke ret mange steder, man kan kan få en ny krop,...