Zehra finder styrke hos sin oprørske storesøster.

Lejren kan ikke holde stand mod de serbiske tropper, og under dramatiske omstændigheder føres den lille bosniske familie til Srebrenica, hvor Zehra og hendes mor bliver skilt fra de øvrige familiemedlemmer. Det lykkes mor og datter at slippe væk fra Srebrenicas rædsler, men ikke længe efter må de på flugt igen. Denne gang med en transport, der bringer dem til Danmark, hvor de søger asyl.

Danmark er et land fuld af muligheder for en ung kvinde med mod på livet. Men det er også et land, hvor man som asylansøger officielt ikke kan gøre meget andet end at vente.

Zehras flugt er historien om krig og en familie i opløsning, om livet som flygtning, både i hjemlandet og i Danmark. Det er også historien om en tænksom pige, som i skyggen af alt det forfærdelige modnes til kvinde og forelsker sig i en mand i Danmark. Et forhold, der udvikler sig overraskende, og som forstærker Zehras eksistentielle overvejelser om krig og kærlighed, ondt og godt, om frihed, religion og nationalisme, og alt det dejlige et almindeligt liv må kunne indeholde.